上海第二医科大学是教育部正式批准开展现代远程教育的首批单科类医科试点高校,于2002年6月28日正式挂牌成立了上海第二医科大学远程教育学院，作为实施医学网络教育的二级学院。学院积极探索以现代远程教育技术构建中国医学连续教育体系的教育服务新模式，并于2002年秋季开始招生。目前已开设护理学专业和公共事业管理、生物医学工程等医学相关类。
    2005年7月18日，上海第二医科大学与上海交通大学合并，

成立新上海交通大学，崭新的上海交通大学医学院由教育部、上海市政府继续重点共建。10月，上海交通大学医学院发文：“原上海第二医科大学远程教育学院更名为上海交通大学网络教育学院医学院分院”。
    学院下设学院办公室、教学管理部、教育技术部和招生和事业发展部等四个职能部门，拥有一支老中青相结合的管理队伍，制定了一套完善和行之有效的管理办法。根据教育部的有关规定，学院积极稳妥地发展校外学习中心，特别是重点建设了一批为西部和农村学员提供学习支持服务的教学基地。
    学院聘请校内外高素质的教师，组成了一支优秀的教师队伍，对校外学习中心辅导教师提出了教学实践培训方案。除了使用学校同类专业统编的教材之外，还请教师编写适应远程学员个性化学习的辅导教学资料，以利于提高学员自治学习和独立学习能力，更加全面地掌握所学的知识。学院拥有专门的卫星转发平台和一批优秀的技术人员，使我院的"天网"和"地网"有效连接和运作，确保信息畅通，教学工作有条不紊地进行。通过卫星转播的教学课件，各校外学习中心学员能够及时、清晰地收看教学内容；通过我院www.mechina.org网站，学员可快速查阅招生简章、规章制度、课程安排、教学课件、成绩报告等内容。